Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms