Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms