Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
YY1P25490 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
YY1P25490 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
YY1P25490 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
YY1P25490 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YY1P25490 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
YY1P25490 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
YY1P25490 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
YY1P25490 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
YY1P25490 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
YY1P25490 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
YY1P25490 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
YY1P25490 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
YY1P25490 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
YY1P25490 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
YY1P25490 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YY1P25490 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YY1P25490 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YY1P25490 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
YY1P25490 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YY1P25490 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YY1P25490 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YY1P25490 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YY1P25490 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YY1P25490 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
YY1P25490 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YY1P25490 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms