Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF1O43189 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms