Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPMQ9NSP4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms