Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GTF3C6Q969F1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GTF3C6Q969F1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GTF3C6Q969F1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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