Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms