Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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ECM1Q16610 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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ECM1Q16610 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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ECM1Q16610 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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ECM1Q16610 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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