Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms