Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms