Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms