Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTLA4P16410 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTLA4P16410 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTLA4P16410 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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