Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms