Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EBF4Q9BQW3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms