Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPIFA3Q9BQP9 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms