Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3Q8TDD5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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