Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP1Q86WV1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms