Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HADHQ16836 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HADHQ16836 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HADHQ16836 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HADHQ16836 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HADHQ16836 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HADHQ16836 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HADHQ16836 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HADHQ16836 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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