Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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