Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms