Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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