Protein–RNA interactions for Protein: Q12882

DPYD, Dihydropyrimidine dehydrogenase [NADP(+)], humanhuman

Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPYDQ12882 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms