Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHF24Q9UPV7 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms