Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMC3IPQ9P2W1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMC3IPQ9P2W1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms