Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSD3Q9NYI0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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