Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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