Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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