Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms