Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms