Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB2P29033 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB2P29033 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms