Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms