Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT1P21579 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms