Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms