Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXQ1Q9C009 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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