Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms