Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR44Q5JSH3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms