Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA5AQ13591 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms