Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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IFT88Q13099 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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IFT88Q13099 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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IFT88Q13099 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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IFT88Q13099 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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IFT88Q13099 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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IFT88Q13099 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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