Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MANFP55145 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MANFP55145 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms