Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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GSK3BP49841 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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GSK3BP49841 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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GSK3BP49841 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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GSK3BP49841 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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GSK3BP49841 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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GSK3BP49841 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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GSK3BP49841 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GSK3BP49841 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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