Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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