Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms