Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SDSP20132 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SDSP20132 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SDSP20132 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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