Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH1P12830 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH1P12830 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH1P12830 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH1P12830 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH1P12830 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH1P12830 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms