Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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