Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F8A0AVK6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms