Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms