Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA6Q92908 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms