Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFA9Q16795 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms