Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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